Символом развала страны и настоящей катастрофы для моряков в 1990-х годов стала роковая судьба третьего героя-нахимовца – Тимура Апакидзе. Он отказался присягать Украине и вывел в Россию свою эскадрилью. 26 сентября 1991 года Тимур первым из морских лётчиков осуществил посадку корабельного истребителя на палубу авианосца «Адмирал Кузнецов». В августе 1995-го за мужество и героизм, проявленные при испытании новой техники, ему было присвоено звание Героя России. 17 июля 2001 года нелепый случай прервал его головокружительный полет.
А в это время его однокашники, учившиеся с ним в 1968-1971 годах, отмечали 30-летие своего выпуска. Их поразил развал и разруха, царившая в это время в училище. И произошло нечто новое – выпускники «сбросились» на ремонт. Ремонт был мелким, но он открыл большую страницу в истории училища: с этого момента выпускники стали хоть изредка и не все, но все-таки помогать училищу. Так появился клуб ветеранов нахимовцев. Его возглавили Ю.Э. Барабанщиков, В.В. Шоферов (вып. 1971 г.) и С.В. Ларев (1973 г.). Первыми членами клуба стали их одноклассники: И.Э. Бибилов зам. председателя «Союза ветеранов воздушно-десантных войск»; О.А. Василевич зам. начальника коммерческого управления; В.В. Беликов, член-корреспондент Международной Академии наук экологической безопасности (МАНЭБ). Они же взяли на себя огромную работу по подготовке к празднованию 60-летнего юбилея. Клубная работа позволила также взяться за написание полновесной истории Нахимовского училища.
Началась эта работа с восстановления памяти. По инициативе зам. председателя Морского собрания С.В. Захарова была установлена памятная доска, посвященная однокласснику Тимуру Апакидзе. Скоро к этой доске прибавилась еще – ПЛ «Комсомолец» (1989г.), на которой погиб штурман Михаил Смирнов и проявил мужество (то есть сумел спастись) Андрей Махота. И еще - «Курск» (2000г.). Там бывших нахимовцев было восемь. Капитаны 3-го ранга: И.В. Щавинский (вып.1986 г.), А.В. Милютин (вып.1989 г.), С.Н. Логинов (вып.1990 г.); капитан-лейтенанты: Д.А. Репников (вып.1990 г.), М.А. Сафонов (1991 г.), С.Н. Логинов; капитан м/с А.Б. Станкеев (1991 г.), старший лейтенант В.Я. Бубнов (1994 г.). Глазами ветеранов – совсем еще мальчишки. В памяти училища они останутся симпатичными застенчивыми юношами. Из того же ряда и нахимовец Д.В. Петровский (1994г.), который получил нож в сердце только за то, что не дал отнять хулиганам бескозырку – как можно, ведь на ленточке четко написано: «НАХИМОВСКОЕ УЧИЛИЩЕ». По счастью он остался жив, и по праву награжден орденом Мужества.
« Мы в жизнь входили по железным трапам, нахимовскими песнями звеня …» . писал Вадим Валунский (вып. 1975 г., погиб 27.7. 1985).
В наше время командирами кораблей стали уже нахимовцы 1980-х годов, такие, как командир АПЛ Юрий Колосов (вып. 1984г.). Выпускники 1982 и 1984 гг. сняли документальный фильм о нахимовцах «Ты слышишь, море!» и стараются оказать училищу практическую помощь. По-прежнему живы традиции. По-прежнему выпускники училища сотрясают монотонность флотских буден, привнося с собой отблеск романтики и отчаянного героизма.